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ausgewählte Publikationen

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Räumliche multiomische Karte des menschlichen Myokardinfarkts

Bildschirmfoto 2022-08-10 um 7.44.32 PM.png

Christoph Kuppe, Ricardo O. Ramirez Flores, Zhijian Li, Monica Hannani, Jovan Tanevski, Maurice Halder, Mingbo Cheng, Susanne Ziegler, Xiaoting Zhang, Fabian Preisker, Nadine Kaesler, Yaoxian Xu, Remco M. Hoogenboezem, Eric MJ Bindels, Rebekka K Schneider, Hendrik Milting, Ivan G. Costa, Julio Saez-Rodriguez, Rafael Kramann

bioXRiv (2020)

Schätzung der Chromatin-Zugänglichkeit aus Einzelzell-ATAC-seq-Daten mit scOpen

Chromatin-accessibility estimation from single-cell ATAC-seq data with scOpen

Zhijian Li*,  Christoph Kuppe* , Susanne Ziegler, Mingbo Cheng, Nazanin Kabgani, Sylvia Menzel, Martin Zenke, Rafael Kramann*, Ivan G Costa*

Naturkommunikation (2021)

Kausale Integration von Multi-Omics-Daten mit Vorwissen zur Generierung mechanistischer Hypothesen

Causal integration of multi-omics data with prior knowledge to generate mechnistic hypotheses

Aurelien Dugourd*Christoph Kuppe *Marco SciacovelliEnio GjergaAttila GaborKristina B EmdalVitor VieiraDorte B Bekker-Jensen ,_cc781905-5cde-3194-bb3b -136bad5cf58d_ Jennifer KranzEric MJ BindelsAna SH CostaAbel Sousa ,_cc781905-5cde-3194-bb3b -136bad5cf58d_ Pedro BeltraoMiguel RochaJesper V OlsenChristian Frezza ,_cc781905-5cde-3194-bb3b- 136bad5cf58d_ Rafael KramannJulio Saez-Rodriguez  

Molekulare Systembiologie (2021)

Decoding myofibroblast origins in human kidney fibrosis

Christoph Kuppe *, Mahmoud M. Ibrahim*, Jennifer Kranz, Xiaoting Zhang, Susanne Ziegler, Javier Perales-Patón, Jitske Jansen, Katharina C. Reimer, James R. Smith,  Ross Dobie, John R. Wilson-Kanamori, Maurice Halder, Yaoxian Xu, Nazanin Kabgani, Nadine Kaesler, Martin Klaus, Lukas Gernhold, Victor G. Puelles, Tobias B. Huber, Peter Boor, Sylvia Menzel, Remco M. Hoogenboezem, Eric MJ Bindels, Joachim Steffens, Jürgen Floege, Rebekka K. Schneider,  Julio Saez-Rodriguez, Neil C. Henderson* & Rafael Kramann*

Natur (2020)

Entschlüsselung der Ursprünge von Myofibroblasten in der menschlichen Nierenfibrose

A functional landscape of CKD entities from public transcriptomic data

Ferenc Tajti*,  Christoph Kuppe *, Asier Antoranz, Mahmoud M. Ibrahim, Hyojin Kim, Francesco Ceccarelli, Christian H. Holland, Hannes Olauson, Jürgen Floege, Leonidas G. Alexopoulos, Rafael Kramann, Julio Saez- Rodríguez

KIBerichte (2019)

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